中国农业科学院深圳农业基因组研究所创建于2014年，是农业农村部和中国农科院整合农业基因组学研究力量在深圳成立的新型研究所。成立以来，基因组所深入贯彻落实习近平总书记“四个面向”“两个一流”指示精神，组建了包含中科院院士和国家杰青等50余位高层次人才在内的近600人的研究队伍；建设了以组学技术为核心、辐射农业、食品和生态方向的学科体系，获批“岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心”“农业农村部农业基因数据分析重点实验室”等创新载体；在 Science、Nature、Cell 等顶级期刊在内的杂志上发表SCI论文300多篇，农业基因组学等研究领域占据世界前沿。多项成果入选“‘十三五’农业科技十大标志性成果”、“中国生命科学十大进展”、“中国农业科学十大进展”。